无菌室，也称为接种室，是无菌处理的专门实验室，例如系统接种、纯化菌种。在微生物工作中，菌种的接种移植是主要的一项操作。该操作的特征是确保菌种的纯种并防止细菌污染。在一般环境的空气中，由于存在许多灰尘和其他细菌，很容易造成污染并严重干扰接种工作。

无菌房间设置
　　应根据经济和科学原则建立无菌室。基本要求如下：
　　（1）无菌室应有内、外有两个房间，里面是无菌室，外面是缓冲室。房间的体积不应太大，便于空气灭菌。内部区域为2×2.5 = 5m2，外部区域为1×2 = 2m2，高度为2.5m或更小。内外都应有天花板。
　　（2）内间应有滑动门，以减少空气的波动。门应设在离工作台远的位置；外门也应用于滑动门，门应位于离内间远的位置。 。
　　（3）在内间与外间墙壁上或隔扇上开一个小窗口，以便为接种过程的内外做必要的通道，以减少人们进出的次数，减少污染程度。小窗宽60cm、高40cm、厚30cm，内外均挂对拉窗扇。
　　（4）无菌室的体积小而严谨。使用一段时间后，室内温度很高，因此应提供通气窗。通气窗应设置在内室入口处的天花板上（离工作台远的位置），好是双层结构，外层是百叶窗，内层可以是板式窗扇。打开通气窗口循环空气，在内室中进行灭菌之前。有条件地安装恒温恒湿机。
无菌室内设备和用具
　　（1）无菌室内的工作台，无论使用何种材料和用途，都需要光滑的表面和工作台水平。
　　（2）在内室和外室中安装紫外灯（多为30W）。内室紫外线灯应安装在常工作的座位正上方，离地面2米，外室紫外线灯可安装在外室中央。
　　（3）外室应有专用工作服、鞋子、帽子、面罩、瓷盆和毛巾用Suer水、手动喷雾器和5％碳酸溶液。
　　（4）内室应有酒精灯、常用接种工具、不锈钢刀、剪刀、镊子、70％酒精棉球、工业酒精、载玻璃片、特殊蜡笔、记录本、铅笔、标签纸、胶水、废纸篓等。
　　（1）熏蒸：这是对无菌室进行彻底灭菌的措施。无菌室应该使用很长时间。当污染严重时，应该进行熏蒸。它可以用甲醛、乳酸或硫磺熏蒸。
　　（2）喷雾：每次使用无菌室之前。喷雾可以促进空气中颗粒和微生物的沉淀，防止桌面、地面上的尘埃飞扬并具有杀菌作用。喷洒5％的碳酸。
　　（3）紫外线照射：每次使用无菌室之前。紫外线具有良好的杀菌效果。通常，紫外灯应开启30至60分钟。
无菌室工作程序
　　（1）在无菌室中灭菌。紫外灯在每次使用前打开超过30分钟，内室和外室喷洒5％的碳酸。
　　（2）用肥皂洗手后，将所需设备带入外室；在外室更换灭菌消毒的工作服、工作帽和工作鞋，戴上口罩，然后用2％酚皂浸泡手2分钟。 。
　　（3）将各种所需物品移入内室检查位置、，在工作面上方喷洒5％碳酸和操作员站位，返回外室，然后进入内室10分钟。
　　（4）接种前，用70％酒精棉球擦手；在进行无菌操作时，动作要轻柔缓慢，尽量减少空气波动和地面灰尘。
　　（5）工作期间应注意安全。如果棉塞着火，请用手握住或用湿布包裹。不要用嘴吹它以免扩大燃烧。如果细菌培养物溢出或打碎有菌容器时，则用浸有5％碳酸的抹布涂抹。用浸有5％碳酸的抹布擦拭台面或地板，再用酒精棉球擦拭手，然后继续操作。

　　（6）在工作结束时，立即清洁台面，将不应存放在无菌室内的所有物品和废物从无菌室中取出，用5％碳酸喷洒无菌室，或打开紫外线灯30分钟。